手術の麻酔には局所麻酔、主に臍より下の部分の手術に適応のある半身麻酔（腰椎麻酔）、全身麻酔があります。麻酔科は、主に手術時の全身麻酔を担当しています。全身麻酔では、小指程度の太さの管を口より（鼻からのこともあります）気管内に挿入します。これを気管内挿管といいます。このような太い管を入れるため手術後しばらくの間、嗄声（声が嗄すれ）が起こり、喉が痛くなります。嗄声は2〜3ヶ月続くことがあります。また、管を入れる際に歯が折れたり欠けたりすることがあります。
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